Учреждение основано 17 марта 1995 года приказом Комитета по здравоохранению города Москвы № 175. С первого дня работы по сегодняшний день здесь реализуется идея оказания специализированной медицинской помощи детям с тяжелыми врожденными и приобретенными патологиями от первых часов жизни до 18 лет.

Лицом Центра стали созданные медицинские школы неврологии, нейрохирургии, онкологии, офтальмологии, челюстно-лицевой хирургии, оториноларингологии, урологии, реабилитации. Сегодня в Центре 12 медицинских направлений, в каждом из которых Учреждение является лидером внедрения в практику уникальных методов лечения. Современное техническое оснащение – новейшие инструменты и медицинское оборудование, позволяют проводить сложнейшие операции, часто впервые в Российской Федерации.

Научный потенциал Центра характеризуется активным участием наших специалистов в научных исследованиях, в самых авторитетных международных и отечественных научных конференциях, проведением собственной традиционной научно-практической конференции с международным участием в стенах Центра, выпуском авторитетных монографий и медицинских журналов "Quantum Satis" и "Российский вестник перинатологии и педиатрии".

В Центре сформирован высококвалифицированный коллектив врачей и медицинских сестер, научных работников, служб, обеспечивающих лечебный процесс, благодаря которым достигаются наилучшие результаты лечения сложных, в том числе орфанных заболеваний. Лечение проводится в рамках ОМС, государственного задания, в том числе ВМП и платных медицинских услуг детям из всех регионов Российской Федерации.

Особое внимание уделяется образованию, развитию, и комфорту наших пациентов. В учреждении работает общеобразовательная школа, проводятся детские мероприятия. Удобные палаты, игровые зоны, зимний сад в Атриуме, ухоженная территория - это всё помогает детям и их родителям провести время в Центре с большой пользой и успешно решить вопросы детского здоровья.